随同军政法令颁布的是具体的各项制度和法律，军事制度的改革，各级官员的任命，秦州的体制基本确立。伟大的学者、评论家爱墨生对此的评价算是一语道破了叶鹰的目的。“军政法令以及同时出台的制度为金鹰帝国提供了大批的免费兵员和战争后勤运送人员。”

事实正是如此，军事改革分几步。首先就是编制，采用编制：10人为一小队，10小队为1中队，合100人，拥有战旗一面；10个中队编为一个团队，合1000人，队长为团长；5个团编为一旗，统领称旗长，旗作为军事编制的单位存在，战时根据情况抽调组建机动兵团。各旗悬挂帝**旗，战斗突出者经授权方可制作属于自己的战旗。

军衔分为：列兵、士兵、小队长、中队长、（大队长）团长、旗长、将军、元帅七等，每等分为下、中、上或铜、银、金三级。

军队分为：野战军、城防军、警卫军、宪兵、预备军、民兵五种。野战军肩负着机动作战的主要任务。士兵最低级定为中士。城防军主要肩负城防守卫，以内线作战为主，并在需要时组建野战军，士兵最低级定为下士。警卫军负责城市治安，协助地方官员处理政务，士兵最低级定为下士。宪兵负责对军队以及地方官员的工作进行监察，反间谍等任务，士兵最低级定为中士。以上均成为正规军，预备军则负责为正规军提供兵员，辅助城防军守卫城池，为前线运送物资，看管俘虏等指派的任务，士兵最低级定为中列。民兵负责建设各种军事工程，制造战争物资的任务，士兵最低级定为下列。

通过军政法令，秦州成功的将因为战乱背井离乡的大量百姓吸引到秦州，为将要进行的水利工程储备了大量的免费劳工。同时，对商业的规范管制以及税收的降低，加上大量人员迁到西北开荒拓土，秦州新建新民城的巨大商机使得商人越来越多的聚到秦州。而军事方面的改革，只有士兵以上级别才发放军饷，预备军和民兵大量的列兵都是没有军饷的，战时只提供必要的消耗，却承担着原来部分正规军担负的部分任务。这样彻底把正规军解放出来，专门负责作战任务，把清理战场，运送军需物资，看管押送俘虏，挖掘修整防御等大量准备工作交给了预备军，日后在战场上证明了这种改革除了节省军费外的另一大优点。

至于如何实施这些复杂的制度，那已经交给了公主殿下新委任的秦州政务长。叶鹰来不及处理蒙凉那边的求援，相比于贵州，他有更重要的事情要做。权衡再三，只得以公主的名义让蒙凉带领人马退入秦州。

蒙凉此时只有少数将领响应，自知敌不过敌人，还好不少将领多少感念赵武之恩，暗中放水，蒙凉就这样退入了秦州，大约3万兵马。

叶鹰赶到蒙古之时，蒙古各旗会盟已经结束，共同推选了博尔达赤的父亲为可汗，建立蒙古国。对于父亲暗中与胡朗交往不满的赤云将情况告诉了叶鹰，无奈之下，叶鹰迁怒于胡朗使者，暗杀其于帐中。随后，命人传话给曾经收服的马贼头子王毅引所部入秦州，确认王胡子的忠诚后，一起向秦州进发。博尔也不满于父亲对诺言的背叛，和妹子带领本旗兵马追赶叶鹰而去。